PCR是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的簡(jiǎn)稱(chēng),是一種酶促化學(xué)反應(yīng),可以在試管里將待測(cè)的目的基因在很短的時(shí)間內(nèi)擴(kuò)增五十萬(wàn)倍乃至上百萬(wàn)倍,大大提高了基因診斷的靈敏度,降低了分析的難度。PCR法是目前基因診斷中使用Z多的方法。下面就讓小編帶你了解一下PCR的反應(yīng)流程。
PCR反應(yīng)流程
1.溫度與時(shí)間的設(shè)置
對(duì)變性-退火-延伸三個(gè)溫度點(diǎn)進(jìn)行設(shè)置。在標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)中,采用三溫度點(diǎn)法,當(dāng)溫度為90-95攝氏度時(shí),雙鏈DNA變性,再將溫度迅速降低到40-60攝氏度退火,Z后將溫度提升到70-75攝氏度延伸。對(duì)于長(zhǎng)度為100-300bp的短靶基因,可以采用二溫度點(diǎn)法,就是將退火和延伸的溫度合二為一,通常在94攝氏度變性,在65攝氏度左右退火和延伸。

(1)變性溫度和時(shí)間
變性的溫度通常為93-94攝氏度,使模板變性的時(shí)間1分鐘足夠,如果溫度小于93攝氏度,那么需要適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間。然而溫度不能夠過(guò)高,否則會(huì)影響酶的活性。
(2)退火溫度與時(shí)間
退火溫度會(huì)對(duì)PCR特異性產(chǎn)生重大的影響。靶基因序列的長(zhǎng)度、堿基組成和濃度以及引物的長(zhǎng)度決定了退火的溫度和時(shí)間。
在Tm值允許范圍內(nèi),選擇較高的復(fù)性溫度可以使得引物和模板間的非特異性結(jié)合大大減少,從而使得PCR反應(yīng)的特異性提高。
(3)延伸溫度與時(shí)間
延伸的溫度通常在70-75攝氏度之間選擇。72攝氏度為延伸常用的溫度,如果延伸的溫度過(guò)高,那么會(huì)對(duì)引物和模板的結(jié)合不理。延伸的反應(yīng)時(shí)間取決于待擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度。如果DNA片段的長(zhǎng)度在1kb以?xún)?nèi),那么延伸時(shí)間1分鐘足夠。如果靶序列的長(zhǎng)度為3-4kb,延伸時(shí)間需要3-4分鐘,如果擴(kuò)增10kb的長(zhǎng)度,那么延伸時(shí)間需要到15分鐘。如果延伸時(shí)間過(guò)長(zhǎng)的話,會(huì)引起非特異性擴(kuò)增,如果擴(kuò)增的模板濃度低,那么需要適當(dāng)延長(zhǎng)延伸時(shí)間。
2.循環(huán)次數(shù)
循環(huán)的次數(shù)決定了PCR的擴(kuò)增程度,循環(huán)的次數(shù)主要由模板DNA的濃度決定。循環(huán)的次數(shù)一般選在30次左右,循環(huán)的次數(shù)越多,非特異性產(chǎn)物的量也隨之增加。
PCR產(chǎn)物檢測(cè)
瓊脂糖凝膠電泳(Z常用)、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的直接測(cè)序、限制性?xún)?nèi)切酶酶切分析、分子雜交、層析技術(shù):GX液相色譜(HPLC)和離子交換層析(IEC)以及聚丙烯酰胺凝膠電泳。
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