當多肽在與蛋白受體結合發(fā)揮功能時，某些特殊的結構總是率先被折疊出來，模擬這些結構是多肽類似物合成的主要目的，從而使生物活性得到保持或提高，與此同時，也能夠使多肽的穩(wěn)定性產(chǎn)生變化，使其抗酶解能力得到提高。

多肽類似物合成主要是為了模擬這些結構，保持或提高生物活性，同時也為了改變多肽的穩(wěn)定性，提高其抗酶解能力。

α-螺旋多肽

α-螺旋Z為普通的蛋白結構之一，然而在溶液中，大多數(shù)多肽通常是無規(guī)卷曲的，保持多肽為α-螺旋結構為目前使用Z多的方法，就是在多肽表面通過共價鍵，連接處在α-螺旋結構的兩個氨基酸，選擇的化學鍵包括：二硫鍵，硫醚鍵，酰胺鍵，烯烴鍵（RCM），選擇的位點（i，i+4或i，i+7）。

酰胺鍵

通常利用Lys，Asp（Glu）來對多肽的內(nèi)酰胺環(huán)肽的合成進行選擇性的保護，在固相上直接環(huán)化。FMOC策略中可以采用FMOC-Lys（Aloc），F(xiàn)MOC-Asp（Allyl）。BOC策略中可以采用BOC-Lys（Fmoc），BOC-Asp（OFm）。對于首尾環(huán)肽，能夠先將保護的多肽合成，然后在液相中使目標多肽環(huán)化生成。

烯烴鍵（RCM）

RCM反應是一個過渡金屬催化反應，其反應中使用(Cy3P)2Cl2Ru=CHPh催化劑，能夠?qū)⑾N催化環(huán)化，過程中將一分子乙烯脫去。

二硫鍵

在蛋白結構中廣泛存二硫鍵，其對穩(wěn)定蛋白結構的意義非常的重要，二硫鍵通常是通過序列中的2個Cys的巰基，經(jīng)氧化形成。有過氧化氫氧化法，DMSO氧化法，空氣氧化法等多種方法能夠使二硫鍵形成。能夠通過Ellman檢測以及HPLC檢測方法監(jiān)測二硫鍵的合成過程中的反應進程。

硫醚鍵

能夠通過序列中的Lys來形成硫醚鍵，在Lys的側鏈氨基上連接溴乙酸，在緩沖溶液中利用其和巰基的特異性反應進行迅速GX的反應。