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實操技巧|光纖記錄實驗數(shù)據(jù)處理操作方法

來源:深圳市瑞沃德生命科技股份有限公司 更新時間:2021-07-01 17:05:59 閱讀量:2574

你在進行光纖記錄實驗時,是否有如下煩腦:

◆ 記錄好的數(shù)據(jù)看著很雜亂,不知如何整理?

◆ 數(shù)據(jù)處理包含哪些步驟?

◆ 如何確定數(shù)據(jù)分析的baseline

◆ ΔF/F指的是什么?

◆ 信號出現(xiàn)了“漂白效應(yīng)”怎么辦?

無需困惑,對以上問題,我們Z近總結(jié)了一份實操步驟,這份操作指南可幫你迅速上手?jǐn)?shù)據(jù)處理


常見光纖記錄數(shù)據(jù)處理過程

讓我們來看一張原始數(shù)據(jù)案例圖,下圖顯示數(shù)據(jù)整體波動過于密集,其中410nm對照通道數(shù)據(jù)不夠穩(wěn)定;對應(yīng)事件標(biāo)記(線條標(biāo)記處)的peak也不是很突出,針對這種數(shù)據(jù)情況,我們立刻開始數(shù)據(jù)處理吧。

(▲本文實操分析案例圖)

(*以下分析過程以瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng)操作界面為主要示例)

01.第 一步

我們將數(shù)據(jù)根據(jù)需要分析的時間段進行裁剪,此步驟也可跳過。

02.第二步

數(shù)據(jù)預(yù)處理。常見數(shù)據(jù)預(yù)處理過程包含平滑處理,基線矯正,運動矯正。平滑處理可以將數(shù)據(jù)中的過多雜信號去除,ZD限度的突出目標(biāo)peak。如下圖所示,原始數(shù)據(jù)經(jīng)平滑處理后目標(biāo)peak更加突出,更容易觀察分析。

基線矯正多數(shù)針對的是熒光信號因長時間記錄導(dǎo)致漂白信號逐步下降,或者光纖的自發(fā)熒光在長期記錄下逐步被漂白基線逐步下降等情況。此情形的數(shù)據(jù)因為整體呈現(xiàn)下降趨勢,不利于后續(xù)數(shù)據(jù)作圖分析,所以需要進行基線矯正。如下圖所示,基線矯正可以直接將下降趨勢的數(shù)據(jù)通過算法擬合后恢復(fù)成平整狀態(tài)。

運動矯正用于采用410nm對照通道的數(shù)據(jù),410nm數(shù)據(jù)可以用于反應(yīng)背景噪音信號,運動矯正即將410nm數(shù)據(jù)與470nm數(shù)據(jù)進行擬合,通過算法從470數(shù)據(jù)中去除410nm數(shù)據(jù)的波動,得到真實的熒光數(shù)據(jù)。當(dāng)不選擇運動矯正功能或者實驗未記錄410nm的數(shù)據(jù),可以選擇一定時間范圍內(nèi)的信號作為對照進行算法處理。

03.第三步

數(shù)據(jù)預(yù)處理后即可得到整體數(shù)據(jù)的ΔF/F或者Z-score,用于反應(yīng)數(shù)據(jù)的波動幅度。二者采用了不同的算法,數(shù)據(jù)的呈現(xiàn)結(jié)果略有不同。

ΔF/F=(F-F1)/F0:

(1)當(dāng)數(shù)據(jù)進行基線矯正后:

◆ 若對照選擇為410,F(xiàn)1=fitted410,F(xiàn)0=median(raw data)

◆ 若對照選擇非410:F1為基線矯正曲線值,F(xiàn)0=median(Baseline)

(2)當(dāng)數(shù)據(jù)未進行基線矯正:

◆ 若數(shù)據(jù)對照為410,則F1=F0=fitted410,

◆ 若數(shù)據(jù)對照非410,則F1=F0=median(Baseline)

Z-score:

使用標(biāo)準(zhǔn)分?jǐn)?shù)計算方式,即z-score=(x-mean)/std,x=ΔF/F,mean為ΔF/F的均值,std為相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)差。

04.第四步

將熒光數(shù)據(jù)與動物行為數(shù)據(jù)同步對比,選擇事件標(biāo)記或者增加事件標(biāo)記。

05.第五步

選擇事件分析的時間區(qū)間和baseline區(qū)間,用于事件相關(guān)信號分析作圖。

06.第六步

將不同組的數(shù)據(jù)進行組間對比,即可分析不同處理因素下熒光數(shù)據(jù)的差異。

通過以上步驟,原始的熒光數(shù)據(jù)就可以直接出圖啦。


空軍軍醫(yī)大學(xué)光纖記錄系統(tǒng)培訓(xùn)現(xiàn)場

(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))


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