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熒光壽命成像助力攻克癌癥熱點靶標——四鏈DNA結構

徠卡顯微系統(tǒng)(上海)貿易有限公司 2021-07-06 23:39:18 783  瀏覽
  • 1953年,科學家詹姆斯-沃森和弗朗西斯-克里克發(fā)現(xiàn)了DNA分子的雙螺旋結構,遺傳學的研究進入到分子層次,人們可以更深層的了解遺傳信息的構成和傳遞途徑(圖1A)。近年,科學家在人類癌癥細胞中發(fā)現(xiàn)一種四重螺旋體DNA分子——G-四鏈體(G-quadruplex)。它是由富含串聯(lián)重復鳥嘌呤(G)的DNA或RNA折疊形成的高級結構。G-四分體(G-quartet)是四鏈體的結構單元,由Hoogsteen氫鍵連接4個G形成環(huán)狀平面,兩層或以上的四分體通過π-π堆積形成四鏈體(圖1B)。

     

    有研究表明,G-四鏈體更多的出現(xiàn)在癌細胞等快速分裂的細胞中,與癌基因的啟動子區(qū)域和DNA鏈的端粒區(qū)域相互作用。因此,G-四鏈體結構與DNA復制過程有著緊密聯(lián)系,對于細胞分裂和增殖非常關鍵[1]。那么,通過靶向調控G-四鏈體結構將有望成為選擇性YZ癌細胞增殖的新途徑,G-四鏈體也成為了癌癥ZL藥物的重要靶標。

    圖1.A:James Dewey Waston(左)& Francis Harry Compton Crick(右)

    B:G4-DNA的3D結構

    鑒于G4-DNA參與到很多生物過程當中,開發(fā)用于檢測和可視化細胞中 G4-DNA 結構的工具也尤為重要。倫敦帝國理工學院的研究人員開發(fā)了一種能夠在活細胞中檢測G4-DNA的熒光探針——DAOTA-M2,為人們揭開了這種結構的神秘面紗 [2]。

     

    這種探針具備良好的活細胞滲透性和低細胞毒性,在與G4-DNA結合時會發(fā)出熒光,可以用來觀察G4-DNA是如何與活細胞內的其他分子相互作用的。并且當DAOTA-M2與不同的核酸拓撲結構結合時,將顯示出不同的熒光壽命信息,進而可以區(qū)別雙螺旋DNA和G4 DNA(圖2),因為與四鏈體結合時熒光壽命更長(圖3)。

    圖2. 熒光壽命置換測定的示意圖:競爭對手結合后,DAOTA-M2 從 G4-DNA 轉移到 dsDNA環(huán)境,導致其熒光壽命縮短

    圖3 DAOTA-M2染色的活細胞U2OS細胞核DNA的FLIM分析(a)以 512 × 512 分辨率(λex=477 nm,λem=550–700 nm)記錄的熒光強度圖像,紅線表示用于 FLIM 分析的核分割(b) 來自 a 的 FLIM 圖,顯示在平均壽命 (τw) 9ns(紅色)和 13ns(藍色)之間(c) 平均核強度與平均核壽命(藍點)的二維相關性(d)單個原子核的放大 FLIM 圖 - 顏色代表壽命,由 9ns(紅色)和 13ns(藍色)之間的顏色梯度條定義


    G4-DNA的生物功能是通過動態(tài)的折疊和打開實現(xiàn)。在細胞內,G4-DNA可以自發(fā)折疊,但其打開是由專門的解旋酶來完成。并且在接下來的研究中,科學家發(fā)現(xiàn)哺乳類動物中的DNA 解旋酶 FancJ 和 RTEL1的表達量減少將會導致DAOTA-M2熒光壽命變長(圖4)[3]。因此可以直接利用DAOTA-M2熒光壽命的變化監(jiān)測G4-DNA在活細胞中的動態(tài)變化。

    圖4,減少 FancJ或RTEL1 解旋酶表達如何導致更長的 DAOTA-M2 壽命 (τw)的示意圖

    G4-DNA被認為是潛在癌癥ZL藥物靶點,因此評估給定的 G4-DNA靶向藥物與該結構結合的能力將非常有用。通過不同處理后DAOTA-M2的熒光壽命變化,結果顯示雙羧酸功能化的Ni(Ni-salphen)與G4-DNA有很強的靶向結合能力,會在短時間內導致DAOTA-M2熒光壽命迅速下降。(圖5)

    圖5. 加入結合劑1-7hr的DAOTA-M2 的代表性 FLIM 成像結果(顯示在 6ns(紅色)和 14ns(藍色)之間)共孵育后 使用 DMSO(對照)、Zn-salphen、Nisalphen 。比例尺:20 μm


    在以上的科研工作中,不難發(fā)現(xiàn),JZ的檢測方法是必不可少的,比如貫穿于整篇文獻中的FLIM技術。FLIM(Fluorescence Lifetime Imaging,熒光壽命成像):是一種基于熒光壽命的顯微成像技術,其成像結果提供像素位點的壽命信息,使得我們在熒光強度成像之外,能更加深入地對樣品進行功能性測量。熒光壽命成像具有不同于熒光強度成像的眾多優(yōu)點,如不受熒光物質濃度、光漂白、激發(fā)光強度等因素的影響。會因為分子構象、分子間相互作用、分子微環(huán)境、生理狀態(tài)等條件改變而發(fā)生變化。Leica全新STELLARIS 8 FALCON熒光壽命成像系統(tǒng),搭載新一代白激光(440-790nm)以及HyD X高靈敏度專用檢測器,提供超快速、多維度熒光壽命成像解決方案。

     

    特異性探針與FLIM相結合使用,不僅可以用來監(jiān)測活細胞細胞核中G4-DNA的形成,以及判定小分子藥物與G4-DNA的相互作用,還可以應用于G4-DNA靶向藥物的篩選。這些信息將為癌癥的診斷和ZL帶來了新啟示,更有助于靶向性新療法新藥物的開發(fā)。


    了解更多:https://www.leica-microsystems.com.cn/cn/?nlc=20201230-SFDC-011237




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熒光壽命成像助力攻克癌癥熱點靶標——四鏈DNA結構

1953年,科學家詹姆斯-沃森和弗朗西斯-克里克發(fā)現(xiàn)了DNA分子的雙螺旋結構,遺傳學的研究進入到分子層次,人們可以更深層的了解遺傳信息的構成和傳遞途徑(圖1A)。近年,科學家在人類癌癥細胞中發(fā)現(xiàn)一種四重螺旋體DNA分子——G-四鏈體(G-quadruplex)。它是由富含串聯(lián)重復鳥嘌呤(G)的DNA或RNA折疊形成的高級結構。G-四分體(G-quartet)是四鏈體的結構單元,由Hoogsteen氫鍵連接4個G形成環(huán)狀平面,兩層或以上的四分體通過π-π堆積形成四鏈體(圖1B)。

 

有研究表明,G-四鏈體更多的出現(xiàn)在癌細胞等快速分裂的細胞中,與癌基因的啟動子區(qū)域和DNA鏈的端粒區(qū)域相互作用。因此,G-四鏈體結構與DNA復制過程有著緊密聯(lián)系,對于細胞分裂和增殖非常關鍵[1]。那么,通過靶向調控G-四鏈體結構將有望成為選擇性YZ癌細胞增殖的新途徑,G-四鏈體也成為了癌癥ZL藥物的重要靶標。

圖1.A:James Dewey Waston(左)& Francis Harry Compton Crick(右)

B:G4-DNA的3D結構

鑒于G4-DNA參與到很多生物過程當中,開發(fā)用于檢測和可視化細胞中 G4-DNA 結構的工具也尤為重要。倫敦帝國理工學院的研究人員開發(fā)了一種能夠在活細胞中檢測G4-DNA的熒光探針——DAOTA-M2,為人們揭開了這種結構的神秘面紗 [2]。

 

這種探針具備良好的活細胞滲透性和低細胞毒性,在與G4-DNA結合時會發(fā)出熒光,可以用來觀察G4-DNA是如何與活細胞內的其他分子相互作用的。并且當DAOTA-M2與不同的核酸拓撲結構結合時,將顯示出不同的熒光壽命信息,進而可以區(qū)別雙螺旋DNA和G4 DNA(圖2),因為與四鏈體結合時熒光壽命更長(圖3)。

圖2. 熒光壽命置換測定的示意圖:競爭對手結合后,DAOTA-M2 從 G4-DNA 轉移到 dsDNA環(huán)境,導致其熒光壽命縮短

圖3 DAOTA-M2染色的活細胞U2OS細胞核DNA的FLIM分析(a)以 512 × 512 分辨率(λex=477 nm,λem=550–700 nm)記錄的熒光強度圖像,紅線表示用于 FLIM 分析的核分割(b) 來自 a 的 FLIM 圖,顯示在平均壽命 (τw) 9ns(紅色)和 13ns(藍色)之間(c) 平均核強度與平均核壽命(藍點)的二維相關性(d)單個原子核的放大 FLIM 圖 - 顏色代表壽命,由 9ns(紅色)和 13ns(藍色)之間的顏色梯度條定義


G4-DNA的生物功能是通過動態(tài)的折疊和打開實現(xiàn)。在細胞內,G4-DNA可以自發(fā)折疊,但其打開是由專門的解旋酶來完成。并且在接下來的研究中,科學家發(fā)現(xiàn)哺乳類動物中的DNA 解旋酶 FancJ 和 RTEL1的表達量減少將會導致DAOTA-M2熒光壽命變長(圖4)[3]。因此可以直接利用DAOTA-M2熒光壽命的變化監(jiān)測G4-DNA在活細胞中的動態(tài)變化。

圖4,減少 FancJ或RTEL1 解旋酶表達如何導致更長的 DAOTA-M2 壽命 (τw)的示意圖

G4-DNA被認為是潛在癌癥ZL藥物靶點,因此評估給定的 G4-DNA靶向藥物與該結構結合的能力將非常有用。通過不同處理后DAOTA-M2的熒光壽命變化,結果顯示雙羧酸功能化的Ni(Ni-salphen)與G4-DNA有很強的靶向結合能力,會在短時間內導致DAOTA-M2熒光壽命迅速下降。(圖5)

圖5. 加入結合劑1-7hr的DAOTA-M2 的代表性 FLIM 成像結果(顯示在 6ns(紅色)和 14ns(藍色)之間)共孵育后 使用 DMSO(對照)、Zn-salphen、Nisalphen 。比例尺:20 μm


在以上的科研工作中,不難發(fā)現(xiàn),JZ的檢測方法是必不可少的,比如貫穿于整篇文獻中的FLIM技術。FLIM(Fluorescence Lifetime Imaging,熒光壽命成像):是一種基于熒光壽命的顯微成像技術,其成像結果提供像素位點的壽命信息,使得我們在熒光強度成像之外,能更加深入地對樣品進行功能性測量。熒光壽命成像具有不同于熒光強度成像的眾多優(yōu)點,如不受熒光物質濃度、光漂白、激發(fā)光強度等因素的影響。會因為分子構象、分子間相互作用、分子微環(huán)境、生理狀態(tài)等條件改變而發(fā)生變化。Leica全新STELLARIS 8 FALCON熒光壽命成像系統(tǒng),搭載新一代白激光(440-790nm)以及HyD X高靈敏度專用檢測器,提供超快速、多維度熒光壽命成像解決方案。

 

特異性探針與FLIM相結合使用,不僅可以用來監(jiān)測活細胞細胞核中G4-DNA的形成,以及判定小分子藥物與G4-DNA的相互作用,還可以應用于G4-DNA靶向藥物的篩選。這些信息將為癌癥的診斷和ZL帶來了新啟示,更有助于靶向性新療法新藥物的開發(fā)。


了解更多:https://www.leica-microsystems.com.cn/cn/?nlc=20201230-SFDC-011237




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