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測序深度

hc4560 2017-11-26 05:57:47 933  瀏覽
  • 百度百科的解釋是“測序深度(Sequencing Depth):測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小(Genome)的比值,它是評價測序量的指標之一?!?我的問題是:所說的“測序得到的堿基總量(bp)”,是得到的Z原始的堿基總量?還是filter、去雜之后的堿基總量?

參與評論

全部評論(1條)

  • 漢共操耗侄障說 2017-11-26 06:18:40
    測序得到的堿基總數就是原始的測序數據,其中會包括一些低質量的堿基,通過去除低質量的堿基,再去除片段過短的序列,得到高質量的序列用于后續(xù)分析。一般評價測序深度都是用過濾之后高質量的序列來進行評估的,這些序列也將參與后續(xù)的分析。

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測序深度
百度百科的解釋是“測序深度(Sequencing Depth):測序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評價測序量的指標之一?!?我的問題是:所說的“測序得到的堿基總量(bp)”,是得到的Z原始的堿基總量?還是filter、去雜之后的堿基總量?
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  普通的二代測序,全基因組或外顯子組測序是將DNA分成小片段,然后對各個片段多次讀取(一般是三十次)。然而,如果突變只發(fā)生在15-20%的細胞中,三十次讀取還不足以可靠地捕捉到它們,尤其是當突變只影響一個基因拷貝時。

  Walsh和博士后Saumya Jamuar通過“定向高覆蓋度測序”技術,為158名腦部疾病的患者鑒定致病突變,這些患者的癥狀包括癲癇、智力障礙、語言障礙等。

  研究人員并沒有分析整個基因組或外顯子組(所有蛋白編碼基因),而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上,并且大大提高了測序的深度。

  在一些疾病如唐氏綜合征中,嵌合突變相較于影響全身細胞的突變,產生的癥狀要輕一些。但是很少量的變異細胞就足以引發(fā)損害人身心健康的癥狀,在以往的研究中,為了從普通基因組中檢測到這些突變,研究人員就不得不增加測定的序列數量。而對少數候選基因區(qū)域進行的平均300次深度測序,就可以有效辨別被誤認為測序錯誤的突變。


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深度計有輻射嗎

深度計有輻射嗎?這是許多使用者在選擇潛水設備時心頭常常浮現(xiàn)的問題。深度計作為潛水過程中不可或缺的裝備,幫助潛水員實時監(jiān)測水深,從而確保安全潛水。關于深度計是否存在輻射,尤其是輻射安全性,很多人持有疑慮。本篇文章將全面解析深度計的工作原理,探討其是否涉及輻射,分析常見的輻射類型及其對人體安全的影響,旨在幫助廣大潛水愛好者理性看待深度計的安全性問題。


理解深度計的類型是關鍵。目前市場上主要的深度計可以分為機械式與電子式兩大類。機械式深度計通過壓縮彈簧或壓力感應器來顯示潛水深度,不涉及任何形式的輻射,因此這類設備完全不存在輻射風險。電子式深度計通常采用壓力傳感器,將水壓轉換成電信號,再由數字顯示屏顯示潛水深度。這里的核心問題在于,電子式設備是否涉及輻射。


電子深度計的工作原理一般依賴微型壓力傳感器和電路板,這些電子部件通常需要電源供能,例如電池。電池供電的電子設備確實會產生電磁場,但這種電磁場的強度遠低于人們日常接觸的輻射水平。更重要的是,電子深度計并不依賴輻射來測量水深,而是利用壓力傳感器感受水壓,再通過電路轉換成顯示信息。這一點與放射性輻射無關。


關于輻射的概念,常見的輻射主要包括紫外線、X射線、伽馬射線等輻射類型。從原則上講,電子深度計不會發(fā)出任何形式的電磁輻射,尤其是放射性輻射。這意味著它不會對潛水員產生輻射輻射的風險。即使電子元件會產出微弱的電磁場,也遠低于被國際輻射防護機構認定為有害的水平,不會對人體健康構成任何已知威脅。


潛水設備制造商在產品設計上嚴格遵守安全標準,確保所有電子組件符合相應的國際認證和安全法規(guī)。用戶在購買時也可以留意相關認證標簽,比如CE、FCC等。這些認證的存在進一步保證了設備在輻射安全方面達到了行業(yè)標準。


科學研究以及國際安全指南明確表明,普通電子設備(包括深度計)中產生的電磁場在正常使用范圍內對人體無害。潛水員無需擔心使用過程中接觸到輻射風險,更無需擔心長期暴露帶來的潛在危害。


總結來看,絕大多數深度計,無論機械還是電子,既不涉及放射性輻射,也不會產生有害的電磁輻射。潛水員可以安心使用這些設備來保障潛水安全,而不必擔心輻射帶來的健康風險。正確了解深度計的工作原理和安全標準,有助于消除誤解,享受安全、愉快的潛水體驗。


2025-10-27 15:30:23 92 0

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