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QExactive一小時(shí)DDA鑒定DIA定量Hela 蛋白

本文由 賽默飛色譜及質(zhì)譜 整理匯編

2018-08-10 10:58 314閱讀次數(shù)

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數(shù)據(jù)非依賴(lài)性的掃描模式(data-independentacquisition,DIA)是近幾年來(lái)發(fā)展的一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式[1]。它的理念是用二級(jí)碎片離子進(jìn)行蛋白相對(duì)/定量。DIA掃描模式中,超高分辨質(zhì)譜對(duì)特定質(zhì)量范圍內(nèi)的所有母離子進(jìn)行碎裂,采集所有母離子的碎片離子,并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內(nèi)的所有碎片離子。DIA的數(shù)據(jù)中包含了所有碎片離子的保留時(shí)間和強(qiáng)度信息。用非常小的質(zhì)量偏差寬口(如10ppm)目標(biāo)性地抽提同一肽段的多個(gè)子離子,計(jì)算子離子的強(qiáng)度,就能對(duì)該肽段進(jìn)行鑒定和定量。DIA定量相比傳統(tǒng)的基于母離子強(qiáng)度的DDA定量有選擇性好,定量準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn)[1],所以DIA成為定量蛋白組學(xué)新的發(fā)展方向。QExactiveHF是賽默飛世爾科技在2014年的ASMS上推出的全新靜電場(chǎng)軌道阱超高分辨質(zhì)譜儀(圖1)[2,3]。QExactiveHF采用了分段式四極桿技術(shù)(AdvancedQuadrupoleTechnology,AQT)使離子傳輸效率至少提高了2倍;超高場(chǎng)Orbitrap技術(shù),提高了Orbitrap掃描速度,在15000分辨率時(shí),二級(jí)譜圖的掃描速度是20Hz。這兩項(xiàng)技術(shù)提高了QEHF進(jìn)行DDA、DIA數(shù)據(jù)的采集能力。本文用1小時(shí)快速色譜梯度對(duì)QEHF的DDA鑒定能力和DIA定量能力進(jìn)行考察,同時(shí)從定量肽段數(shù)目和CV兩方面對(duì)DDA定量和DIA定量能力進(jìn)行比較。使用儀器:QExactiveHF

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