分子雜交（molecular hybridization）是指使單鏈核酸堿基序列確定的技術(shù)。待測(cè)單鏈核酸與已知序列的單鏈核酸（叫做探針）間通過(guò)堿基配對(duì)使可檢出的雙螺旋片段形成為分子雜交的基本原理。

歷史

1961年，Hall等開(kāi)始了核酸雜交技術(shù)的工作，在溶液中將探針與靶序列雜交，通過(guò)平衡密度梯度使雜交體離心分離，這種方法，效率低，繁瑣，精確度不高，然而它對(duì)于核酸雜交技術(shù)的研究起到開(kāi)拓作用。

1962年，diyi種簡(jiǎn)單的固相雜交方法（DNA-瓊脂技術(shù)）由Bolton等設(shè)計(jì)而成。

60年代末，另一種分析細(xì)胞基因組的方法由Britten等設(shè)計(jì)出來(lái)，此方法是通過(guò)對(duì)液相中DNA的復(fù)性的研究來(lái)對(duì)不同來(lái)源核酸的復(fù)雜度進(jìn)行比較。

60年代中期，Nygaard等的研究奠定了應(yīng)用標(biāo)記DNA或RNA探針檢測(cè)固定在硝酸纖維素（NC）膜上的DNA序列的基礎(chǔ)。

70年代早期，核酸雜交技通過(guò)許多重要的發(fā)展而使進(jìn)展得到促進(jìn)。

70年代末期到80年代早期，分子生物學(xué)技術(shù)取得了突破性的進(jìn)展。特異性DNA探針的來(lái)源由于各種載體系統(tǒng)的誕生特別是質(zhì)粒和噬菌體DAN載體的構(gòu)建而變得非常豐富。特定基因克隆能夠能夠由基因組DNA文庫(kù)和cDNA文庫(kù)中獲得，僅僅需要對(duì)細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng)，就能夠?qū)⒋罅康奶结楧NA提取出來(lái)，直到今天，許多的特異DNA探針已經(jīng)被克隆和定性了。

因?yàn)楣滔嗷瘜W(xué)技術(shù)和核酸自動(dòng)合成儀的誕生，印跡技術(shù)，DNA的量?jī)H僅需要數(shù)微克，就能夠?qū)μ禺惢蜻M(jìn)行分析?？梢允褂肧outhern印跡和Northern印跡來(lái)測(cè)定特異DNA或RNA序列的量和大小，相比于從前的技術(shù)，雜交水平和可信度得到了大大的提高。