利用肽鍵（酰胺鍵）連接兩個氨基酸組分，同時將水脫去，為形成一個肽鍵即生成一個二肽的簡單的化學(xué)過程。若沒有保護(hù)羧基組分（A）的氨基，則不能控制肽鍵的形成，可能會產(chǎn)生副反應(yīng)。因此，在合成多肽過程中，必須通過可逆的方式暫時保護(hù)不參與肽鍵形成的所有官能團(tuán)。

多肽合成分為三步：

1.需要對部分保護(hù)的氨基酸進(jìn)行制備。

2.N－保護(hù)氨基酸的羧基必須首先活化成活性中間體，然后再形成肽鍵從而使肽鍵的兩步反應(yīng)形成。

3.選擇性脫除或者全部脫除保護(hù)基。雖然需要等到完成肽鏈的全部組裝之后才能全部脫除，然而，為了合成的繼續(xù)進(jìn)行，保護(hù)基的選擇性脫除很有必要。因為Ser、Thr、Tyr、Asp、Glu、Lys、Arg、His、Sec和Cys這0個氨基酸均含有需要選擇性保護(hù)的側(cè)鏈官能團(tuán)，從而增加了肽合成的復(fù)雜性。由于對選擇性的要求的差異，因此，必須對半性和臨時性保護(hù)基進(jìn)行區(qū)分。臨時性保護(hù)基被用來暫時保護(hù)下一步要反應(yīng)氨基酸的氨基或羧基官能團(tuán)。

理想狀態(tài)下，活化羧基組分以及形成肽鍵（耦合反應(yīng)）的反應(yīng)應(yīng)當(dāng)很迅速，不會形成副產(chǎn)物或有消旋，并且應(yīng)用等摩爾反應(yīng)物來使高產(chǎn)率獲得。很遺憾，實際的化學(xué)耦合方法還沒有一種能滿足這些要求。

多肽合成循環(huán)的Z后一步，需要全部脫除保護(hù)基。在二肽的合成中，需要全脫保護(hù)，除此以外，對于肽鏈延長，選擇性脫除保護(hù)基具有十分重要的意義。深思熟慮地規(guī)劃合成很有必要。

起先，固相多肽合成（SPPS）僅是由肽和蛋白質(zhì)逐步合成法變化而來。它的概念為在一個不溶性的聚合物載體上連接增長的肽鏈。1963年RobertBruceMerrifield首次報道。在聚合物載體上，片段縮合反應(yīng)也能夠進(jìn)行。