對特定的DNA片段起到放大擴增作用的一種分子生物學技術,被稱為聚合酶鏈式反應。其可以被當作生物體外的特殊DNA復制,能夠大幅增加微量的DNA。1971年Khorana首先提出設想,1985年Mullis發(fā)明了聚合酶鏈反應。下面就讓小編帶你了解一下PCR反應陰性的原因。
值得注意的是,有有時候會忘記將Taq酶或溴乙錠加入。
物理原因:
對于PCR擴增而言,變性可謂非常的重要,如果變性的時間很短并且變性的溫度很低,那么很有可能導致假陰性的出現(xiàn)。退火事有過低的溫度,可能會造成非特異性擴增,從而使得特異性擴增效率降低。如果退火溫度過高,那么會對引物與模板的結合產(chǎn)生影響從而使得PCR擴增效率降低。有些時候,擴增儀或水溶鍋內的變性、退火和延伸溫度也非常有必要使用標準的溫度計檢測一下,因為這些也很有可能造成PCR失敗。

反應體積的改變:
20ul、30ul、50ul、或100ul為進行PCR擴增時常用的體積。科研和臨床檢測的不同目的決定了應用多大體積進行PCR擴增。如果在做小體積如20ul后,又做大體積,必須先對條件進行摸索,否則非常容易失敗。
Mg2+濃度:
PCR擴增效率受到Mg2+離子濃度非常大的影響,如果Mg2+濃度過高,就會使得PCR擴增的特異性降低,如果Mg2+濃度過低,那么可能會對PCR擴增產(chǎn)量產(chǎn)生影響甚至會導致PCR擴增失敗,擴增條帶沒有出現(xiàn)。
引物:
PCR失敗或擴增條帶不理想、容易彌散通常是由引物質量、引物的濃度、兩條引物的濃度是否對稱造成的。若引物合成質量出現(xiàn)問題,兩條引物一條濃度低,另外一條濃度高,導致擴增效率低下以及擴增不均勻,那么有如下方法。
1.對一個好的引物合成單位進行選定。
2.引物的濃度不但要注意OD值而且要注意引物原液做瓊脂糖凝膠電泳,必須要出現(xiàn)引物條帶,并且兩引物帶需要有大體相同的亮度,如果一條引物沒有條帶,另外一條引物有條帶,那么這個時候做PCR有失敗的可能性。如果一條引物亮度低,另外一條引物亮度高,那么在稀釋引物時需要對其濃度進行平衡。
3.當對引物進行保存時,應該高濃度少量分裝保存,避免長期放冰箱冷藏部分或者多次凍融,造成引物變質,降解失效。
4.引物沒有得到合理的設計,若引物沒有足夠的長度,那么二聚體等會在引物之間形成。
靶序列變異:
如果靶序列發(fā)生突變或缺失,那么會對引物與模板特異性結合產(chǎn)生影響,導致靶序列某段缺失使引物與模板失去互補序列,從而造成PCR擴增失敗
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