手工測(cè)序以及自動(dòng)測(cè)序均屬于DNA序列測(cè)定,手工測(cè)序可分為maxam-gilbert化學(xué)降解法與sanger雙脫氧鏈終止法,事實(shí)上,目前dna序列分析的主流是自動(dòng)測(cè)序。373型、377型、310型、3700和3100型等多種型號(hào)DNA測(cè)序儀均已經(jīng)被美國pe abi公司生產(chǎn)出來了,在這幾款DNA測(cè)序儀中,臨床檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室使用Z多的一種型號(hào)要屬310型。
原理
傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺平板電泳被淘汰,取而代之的是毛細(xì)管電泳,abi prism 310型基因分析儀就是采用毛細(xì)管電泳技術(shù),此公司ZL的四色熒光染料標(biāo)記的ddntp得到應(yīng)用,所以利用單引物pcr測(cè)序反應(yīng),相差1個(gè)堿基的3''''末端為4種不同熒光染料的單鏈dna物混合為生成的pcr產(chǎn)物,使四種熒光染料的測(cè)序 pcr產(chǎn)物能夠在一根毛細(xì)管內(nèi)電泳,從而使泳道間遷移率差異的影響得以避免,使測(cè)序的精確度得到大大的提高,因?yàn)榉肿哟笮〉牟町悾诿?xì)管電泳中有著不一樣的遷移率,當(dāng)其從毛細(xì)管讀數(shù)窗口段經(jīng)過的時(shí)候,激光檢測(cè)器窗口中的ccd(charge-coupled device)攝影機(jī)檢測(cè)器能夠逐個(gè)檢測(cè)熒光分子,利用光柵將激發(fā)的熒光分光,來對(duì)代表不同堿基信息的不同顏色的熒光加以區(qū)分,并且同步成像于ccd攝影機(jī)上,不同熒光經(jīng)過分析軟件能夠被轉(zhuǎn)變?yōu)閐na序列,從而使dna測(cè)序的目的達(dá)到。可以通過熒光吸收峰圖、堿基排列順序或者凝膠電泳圖譜等多種形式將分析結(jié)果輸出。

DNA測(cè)序儀是一臺(tái)對(duì)dna片段的堿基順序或大小進(jìn)行測(cè)定和定量的儀器,其還可以自動(dòng)數(shù)據(jù)收集、自動(dòng)進(jìn)樣以及自動(dòng)灌膠。genescan膠(pop 4)和dna測(cè)序膠(pop 6)等凝膠高分子聚合物由pe公司提供,這些凝膠顆粒有著均一的孔徑,使配膠條件不相同對(duì)測(cè)序精度的影響得以避免。電泳附件、電腦、彩色打印機(jī)、毛細(xì)管電泳裝置等為DNA測(cè)序儀的主要構(gòu)成組件。資料收集,分析和儀器運(yùn)行等軟件均包含在電腦里。因?yàn)槿碌腸cd攝影機(jī)檢測(cè)器為DNA測(cè)序儀所應(yīng)用,使pcr片段大小分析和定量分析時(shí)間縮短為10~40分鐘,dna測(cè)序時(shí)間縮短到2.5小時(shí)。
用途
該儀器的應(yīng)用相當(dāng)?shù)貜V泛,能夠進(jìn)行進(jìn)行dna測(cè)序、雜合子分析、單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(sscp)、微衛(wèi)星序列分析、長片段pcr、rt-pcr(定量pcr)等分析,臨床上不但能夠進(jìn)行常規(guī)dna測(cè)序,而且還能夠進(jìn)行法醫(yī)學(xué)上的親子和個(gè)體鑒定、微生物與病毒的分型與鑒定、基因突變檢測(cè)、hla配型、單核苷酸多態(tài)性(snp)分析等。該儀器之所以有如此多的用途是因?yàn)樵搩x器具有dna測(cè)序,pcr片段大小分析和定量分析等功能。
現(xiàn)狀和意義
當(dāng)今世界,如果要評(píng)說哪個(gè)地方會(huì)誕生傳奇,那么必定是高科技領(lǐng)域,從前DNA測(cè)序還作為一個(gè)前沿技術(shù)令人高山仰止,如今卻成為一個(gè)生命科學(xué)常規(guī)技術(shù),迅速地得到普及,目前為止,能夠和電腦芯片運(yùn)算能力增強(qiáng)的速度相媲美的也就只有DNA測(cè)序成本下降的速度,DNA測(cè)序的發(fā)展除了在降低成本方面得到了體現(xiàn),還在高通量測(cè)序大幅度提高了工作效率方面得以表現(xiàn),其鋪平了DNA測(cè)序產(chǎn)業(yè)化的道路。
Zda的基因組測(cè)序及研究應(yīng)用ZX之一位于深圳的華大基因研究院,華大基因承擔(dān)了人類基因組計(jì)劃1%的工作任務(wù),之后又對(duì)國際HAPmap計(jì)劃進(jìn)行了參與與完成,并且將叫做“炎黃一號(hào)”di一個(gè)ZG人也是di一個(gè)亞洲人的基因組測(cè)序完成了。
有50余個(gè)研究小組在威康信托基金會(huì)中,其是英國Zda的生物醫(yī)學(xué)資助機(jī)構(gòu)之一。雙向障礙病、冠心病、克羅恩氏病、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、高血壓以及I型糖尿病和II型糖尿病等多疾病的基因的篩查這一項(xiàng)頗具野心的龐大計(jì)劃和挑戰(zhàn)由他們?cè)谶^去的幾年開展了。有24處與上述7種疾病相關(guān)的位點(diǎn)通過對(duì)1.7萬名英國人的SNPs篩查分析,在基因組中被找到,有10個(gè)致病基因在II型糖尿病的篩查中被找到和證實(shí)。
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