本次實驗比較了Zxin高分辨質(zhì)譜儀Orbitrap Fusion 使用MS2 定量方法以及SPS MS3 定量方法在定性與定量蛋白質(zhì)數(shù)目以及定量結(jié)果之間的差異，在16h 的總檢測時間內(nèi)，MS2 定量方法一共鑒定了3022 個蛋白質(zhì)，其中有2994 個蛋白質(zhì)有定量結(jié)果，SPS MS3 定量方法一共鑒定到了2788個蛋白質(zhì)，其中有2612 個蛋白質(zhì)有定量結(jié)果從結(jié)果看，由于MS2 定量方法的掃描速度要略高于SPS MS3 定量模式的掃描速度，因而Z終的結(jié)果顯示前者可以鑒定并定量到更多的蛋白質(zhì)，但是SPS MS3 定量方法可以鑒定并定量到更多低豐度的蛋白質(zhì)，此外，由于MS2 定量方法容易受到基質(zhì)干擾，定量差異偏小，結(jié)果不夠準(zhǔn)確 賽默飛Orbitrap Fusion Lumos 三合一質(zhì)譜