1 一級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)定 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定又稱蛋白質(zhì)順序分析，其基本方法是：應(yīng)用化學(xué)裂解法和蛋白酶水解法將多肽鏈專一性裂解逐一測(cè)定每個(gè)純化的小肽段的順序根據(jù)肽段氨基酸順序中的重疊區(qū)確定小肽段的排列次序完成整條多肽鏈的順序分析 盡管蛋白質(zhì)順序分析已經(jīng)自動(dòng)化，但仍然耗時(shí)復(fù)雜并且昂貴重組DNA技術(shù)出現(xiàn)后，人們可以從cDNA或基因序列直接推導(dǎo)出蛋白質(zhì)的氨基酸順序，速度快且經(jīng)濟(jì)，已成為Z常用的測(cè)定蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的方法 2蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)很大程度上決定了蛋白質(zhì)的功能， 目前應(yīng)用X射線晶體衍射圖譜法和核磁共振法已測(cè)定出1萬(wàn)多種蛋白質(zhì)及其復(fù)合物的結(jié)構(gòu)，但與已測(cè)得的30多萬(wàn)種蛋白質(zhì)序列相比，還有很大的差距，大大地影響了人們對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能關(guān)系的研究因此發(fā)展一種不依賴實(shí)驗(yàn)而又有一定準(zhǔn)確性的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法顯得格外重要，近年來(lái)在這個(gè)方面取得了很多重要的成果 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的理論預(yù)測(cè)方法都是建立在氨基酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定高級(jí)結(jié)構(gòu)的理論基礎(chǔ)上，大致分為以下三類 (1)比較建模法 又稱為同源結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，是根據(jù)大量已知的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)來(lái)預(yù)測(cè)序列已知而結(jié)構(gòu)未知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu) (2)反向折疊法 反向折疊法是近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的一種比較新的方法它可以應(yīng)用到?jīng)]有同源結(jié)構(gòu)的情況下，且不需要預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)，直接預(yù)測(cè)三級(jí)結(jié)構(gòu)，從而可以繞過(guò)現(xiàn)階段二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性不超過(guò)65％的限度，是一種有潛力的預(yù)測(cè)方法 (3)從頭預(yù)測(cè)法 從理論上說(shuō)，從頭預(yù)測(cè)法是Z為理想的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法它要求方法本身可以只根據(jù)蛋白質(zhì)的氨基酸序列來(lái)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)和高級(jí)結(jié)構(gòu)，但現(xiàn)在還不能完全達(dá)到這個(gè)要求 根據(jù)對(duì)天然蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析建立起來(lái)的數(shù)據(jù)庫(kù)里的數(shù)據(jù)，可以預(yù)測(cè)一定氨基酸序列肽鏈空間結(jié)構(gòu)和生物功能；反之也可以根據(jù)特定的生物功能，設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)的氨基酸序列和空間結(jié)構(gòu)通過(guò)基因重組等實(shí)驗(yàn)可以直接考察分析結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系 3蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)實(shí)驗(yàn)測(cè)定 根據(jù)蛋白質(zhì)的狀態(tài)，測(cè)定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的方法分為兩大類：應(yīng)用X射線晶體衍射圖譜法和中子衍射法測(cè)定晶體中的蛋白質(zhì)分子構(gòu)象應(yīng)用核磁共振法園(圓)二色性光譜法激光拉曼光譜法熒光光譜法紫外差光譜法和氫同位素交換法等測(cè)定溶液中的蛋白質(zhì)構(gòu)象 其他方法可以測(cè)定溶液中蛋白質(zhì)分子的局部構(gòu)象，但很難獲得蛋白質(zhì)分子完整的三維結(jié)構(gòu)，在應(yīng)用上存在較大的局限性