假定你抽提 rna 時使用到的有機試劑 - 氯仿異丙醇無水乙醇 - 都是國產(chǎn)的 (這是完全可以使用的)我的問題是:你采取了什么措施來降低或者杜絕 RNase 的污染?具體地:
你是如何選擇預(yù)處理使用和保存氯仿和異丙醇?
你是如何配制和保存 75% 乙醇?
坦率地講,因為有機試劑的問題導(dǎo)致抽提失敗,我真沒有聽到;或許有的問題是由有機試劑導(dǎo)致,但使用人也多是不會懷疑到這一點的恐怖分子的行為倒是聽到過:對氯仿75% 乙醇進行高壓滅菌處理令我無言的是,這樣的恐怖行為既沒有導(dǎo)致恐怖的后果,也沒有影響實驗的成功
不過我還是想提供一些建議我關(guān)注的是質(zhì)量控制,而不是單單是簡單或者方便
RNA 抽提中涉及的有機試劑,包括苯酚氯仿異丙醇乙醇苯酚多為商品化的東西了,選擇和保存都不應(yīng)該有什么問題;只強調(diào)一點:盡管 Tris 飽和的苯酚也可以用于 RNA 的抽提,但使用水飽和苯酚會更好一些,因為 RNA 在 pH 7 以上的溶液中,發(fā)生降解的機率大大提高下面是關(guān)于氯仿異丙醇乙醇的有關(guān)建議
選擇
國內(nèi)大的化學(xué)試劑公司生產(chǎn)或者監(jiān)制的分析純級別試劑就完全可以滿足要求
預(yù)處理
不需要進行任何的預(yù)處理不可以高溫高壓滅菌:這不是該不該的問題,而是能與不能的問題這三個試劑的沸點都低于 100C,高溫高壓可能導(dǎo)致危險
75% 乙醇的配制
一份無菌無酶的水與 3 份 (體積)無水乙醇混勻即成不要使用量筒等過渡容器,使用天平來秤量:水的比重為 1,無水乙醇的比重按 0.785 計算是先將無水乙醇倒出部分后再加入水,還是往裝水的瓶子中加入無水乙醇,沒有什么區(qū)別事實上,70% - 80% 的乙醇都具有較好的洗滌能力,同時也不會導(dǎo)致片段比較大的核酸的丟失,所以,配制時就不要為了準(zhǔn)確而左勾右兌的關(guān)于現(xiàn)用現(xiàn)配,從質(zhì)量控制角度看,不是一個好的辦法;這也是你永遠(yuǎn)發(fā)現(xiàn)不了75% 可能會有問題的基礎(chǔ)75% 乙醇也不可以高溫高壓滅菌,原因同無水乙醇
保存
首先,要使用新的試劑;試劑架上別人使用過并寫有標(biāo)記的,一定要找當(dāng)事人確定,以防已被用于其它用途而標(biāo)記未改其次,分成相對小一點的包裝 (50ml 100ml);500ml 的瓶子取液是非常不方便的,移液器的桿子往往都進入了瓶口里,非常容易造成污染第三,塑料瓶子密閉性好,裝醇類試劑是非常好的選擇;但氯仿不要使用塑料瓶子第四,蓋緊瓶蓋,作好標(biāo)記,再在瓶子上蓋上一個透明塑料袋防塵第五,保存于室溫
將有機試劑保存于冰箱的人不在少數(shù),但這么做卻是令人奇怪的首先,任何揮發(fā)性的東西都不保存在冰箱 (除非萬不得已,如 DEPC),這應(yīng)該成為一個良好的習(xí)慣其次,與外面相比,冰箱除了灰塵少一點外,什么都會比外面多的第三,在室溫打開低溫的瓶子,將導(dǎo)致空氣大量進入瓶子,增加了污染的風(fēng)險
使用
非常幸運的是,有機試劑對菌污染和酶污染似乎有我們想象不到的YZ和滅活作用,所以,使用這些試劑沒有特殊的要求,按正常抽提 RNA 的要求就完全可以了吸取有機試劑時,**使用比要吸取的體積大的移液器,因為有機試劑有越吸越多的現(xiàn)象,試劑容易接觸到移液器的桿頭 污染不說,氯仿會腐蝕桿頭的75% 乙醇使用一次性的吸管移取,一次可以吸數(shù) ml,既快又方便如果舍不得丟棄,用完后放入塑料自封袋中保存,是非常安全的
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